Install MITK in Ubuntu16.04LTS

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引言

毕设的项目需使用MITK(The Medical Imaging Interaction Toolkit)套件来进行医学图像处理，因此开始了MITK的踩坑计划，国内外网上的安装贴都无比的少，经过两天的折腾终于把MITK编译成功了！作文以记。
注：本文使用的MITK为2016.11德国版

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Ubuntu16.04LTS

支持的平台，Linux系的官网支持列表如下：

Platform Compilers
Ubuntu Linux 14.04 (x64) GNU 4.9 as provided by ppa:ubuntu-toolchain-r/test
Ubuntu Linux 16.04 (x64) GNU 4.9

为了稳定性以及团队合作各软件版本的统一，重新装回Ubuntu还是很有必要的。

所需软件

  • MITK2016.11，下载点此处
  • QT5.7.1，下载点此处

    // 加可写权限
    chmod +x ./qt-opensource-linux-x64-5.7.1.run
    // 图形化安装
    sudo ./qt-opensource-linux-x64-5.7.1.run

  • Cmake3.7.2，下载点此处

    解压后打开bin文件夹下的cmake-gui即可

编译安装

  1. 解压MITK-2016.11-src.tar.gz
  2. 新建一个文件夹Toolkit，把解压完的文件夹放进去，再新建一个文件夹MITK-2016.11-src-bin用以存放编译完的二进制文件，大致目录如下

    Tookit
    ├─ MITK-2016.11-src
    └─ MITK-2016.11-src-bin

  3. 打开Cmake-gui或者命令行ccmake生成makefile
    create_ssh

    Figure 1. Cmake-gui

    1. source code路径填MITK-2016.11-src文件夹路径
    2. binaries路径填MITK-2016.11-src-bin文件夹路径
    3. 点击下方Configure，选默认的，发现一堆红的，把QT5-DIR路径填上(用上面命令安装的默认路径应该是/opt/Qt5.7.1/5.7/gcc_64/lib/cmake/Qt5`)
    4. 再点下Configure，勾上MITK_USE_OPENCV和MITK_USE_OPENGTLink，其他看需要勾选
    5. 再点Configure到无错误且无红色为止(否则安装缺少的包)
    6. 点击下方Generate即可
  4. 打开终端，进入MITK-2016.11-src-bin文件夹

    make
    // 如果多核可以使用make -j6使用多核编译加快编译速度

  5. 见到如下界面即编译成功
    create_ssh

    Figure 2. make

  6. 打开MITK-2016.11-src-bin/MITK-build/bin/MitkWorkbench,即可见到如下界面：
    create_ssh

    Figure 3. MITK

注：make编译期间特别慢，可考虑以下方式优化：

  1. make期间需下载大量文件，若网速不行可考虑先用axel下载文件再覆盖
  2. 使用make -j6多核加速